配置 Amazon ParallelCluster

安装后Amazon ParallelCluster，完成以下配置步骤。

确认您的Amazon账户拥有的角色包含运行pcluster CLI 所需的权限。有关更多信息，请参阅 Amazon ParallelCluster实例和用户策略示例。

设置您的Amazon证书。有关更多信息，请参阅Amazon CLI用户指南Amazon CLI中的配置。


$ aws configure
  AWS Access Key ID [None]: AKIAIOSFODNN7EXAMPLE
AWS Secret Access Key [None]: wJalrXUtnFEMI/K7MDENG/bPxRfiCYEXAMPLEKEY
Default Amazon Web Services 区域 name [us-east-1]: us-east-1
Default output format [None]:

集群的启动Amazon Web Services 区域位置必须至少有一个 Amazon EC2 key pair。有关更多信息，请参阅适用于 Linux 实例的 Amazon EC2 用户指南中的 Amazon EC2 密钥对。


$ pcluster configure

该配置向导会提示您输入所需的所有信息以创建集群。与使用相比，Amazon Batch用作调度程序时，序列的细节有所不同Slurm。有关集群配置的更多信息，请参阅配置。

注意

从版本 2.11.5 开始，Amazon ParallelCluster不支持使用SGE或Torque调度器。您可以在 2.11.4 及之前的版本中继续使用它们，但它们没有资格获得Amazon服务和Support 团队的future 更新或故障排除Amazon支持。

Slurm

从有效Amazon Web Services 区域标识符列表中，选择您希望集群运行Amazon Web Services 区域的位置。

注意

Amazon Web Services 区域显示的列表基于您账户的分区，仅包括为您的账户启Amazon Web Services 区域用的分区。有关为您的账户启用功能Amazon Web Services 区域的更多信息，请参阅《Amazon一般参考》Amazon Web Services 区域中的管理。显示的示例来自Amazon全局分区。如果您的帐户在Amazon GovCloud (US)分区中，则仅列出该分区Amazon Web Services 区域中的帐户（gov-us-east-1和gov-us-west-1）。同样，如果您的账户位于Amazon中国分区，cn-northwest-1则仅显示cn-north-1和。有关Amazon Web Services 区域支持的完整列表Amazon ParallelCluster，请参阅支持的区域。


Allowed values for the Amazon Web Services 区域 ID:
1. af-south-1
2. ap-east-1
3. ap-northeast-1
4. ap-northeast-2
5. ap-south-1
6. ap-southeast-1
7. ap-southeast-2
8. ca-central-1
9. eu-central-1
10. eu-north-1
11. eu-south-1
12. eu-west-1
13. eu-west-2
14. eu-west-3
15. me-south-1
16. sa-east-1
17. us-east-1
18. us-east-2
19. us-west-1
20. us-west-2
Amazon Web Services 区域 ID [ap-northeast-1]:

选择要用于集群的计划程序。


Allowed values for Scheduler:
1. slurm
2. awsbatch
Scheduler [slurm]:

选择操作系统。


Allowed values for Operating System:
1. alinux2
2. centos7
3. ubuntu1804
4. ubuntu2004
Operating System [alinux2]:

注意

Amazon ParallelCluster版本 2.6.0alinux2 中添加了对的Support。

输入计算节点集群的最小和最大大小。这是以实例数量来衡量的。


Minimum cluster size (instances) [0]:
Maximum cluster size (instances) [10]:

输入了头节点和计算节点的实例类型。对于实例类型，您的账户实例限制足够大，可以满足您的要求。有关更多信息，请参阅适用于 Linux 实例的 Amazon EC2 用户指南中的按需实例限制。


Master instance type [t2.micro]: 
Compute instance type [t2.micro]:

key pair 是从选定的 Amazon EC2 中注册的密钥对中选择的Amazon Web Services 区域。


Allowed values for EC2 Key Pair Name:
1. prod-uswest1-key
2. test-uswest1-key
EC2 Key Pair Name [prod-uswest1-key]:

完成前面的步骤后，决定是使用现有 VPC 还是让我们为您Amazon ParallelCluster创建 VPC。如果没有正确配置的 VPC，Amazon ParallelCluster您可以创建新的 VPC。它要么同时使用同一个公有子网中的头节点和计算节点，要么只使用公有子网中的头节点，所有节点都在私有子网中。可以达到您对一个 VPC 数量的限制Amazon Web Services 区域。默认限制为每个 VPC 五个 VPCAmazon Web Services 区域。有关此限制以及如何请求提高限制的更多信息，请参阅 Amazon VPC 用户指南中的 VPC 和子网。

如果您允许Amazon ParallelCluster创建 VPC，则必须决定是否所有节点都应位于公有子网中。

重要

默认情况下，由创建的 VPCAmazon ParallelCluster 不启用 VPC 流日志。利用 VPC 流日志您可以捕获有关传入和传出您的 VPC 中的网络接口的 IP 流量的信息。有关更多信息，请参阅 Amazon VPC 用户指南 中的 VPC 流日志。


Automate VPC creation? (y/n) [n]: y
Allowed values for Network Configuration:
1. Master in a public subnet and compute fleet in a private subnet
2. Master and compute fleet in the same public subnet
Network Configuration [Master in a public subnet and compute fleet in a private subnet]: 1
Beginning VPC creation. Please do not leave the terminal until the creation is finalized

如果您不创建新的 VPC，则必须选择现有 VPC。

如果您选择Amazon ParallelCluster创建 VPC，请记下 VPC ID，以便稍后Amazon CLI使用将其删除。


Automate VPC creation? (y/n) [n]: n
Allowed values for VPC ID:
  #  id                     name                                 number_of_subnets
---  ---------------------  ---------------------------------  -------------------
  1  vpc-0b4ad9c4678d3c7ad  ParallelClusterVPC-20200118031893                    2
  2  vpc-0e87c753286f37eef  ParallelClusterVPC-20191118233938                    5
VPC ID [vpc-0b4ad9c4678d3c7ad]: 1

选择 VPC 后，您需要决定是使用现有子网还是创建新子网。


Automate Subnet creation? (y/n) [y]: y


Creating CloudFormation stack...
Do not leave the terminal until the process has finished

Amazon Batch

从有效Amazon Web Services 区域标识符列表中，选择您希望集群运行Amazon Web Services 区域的位置。


Allowed values for Amazon Web Services 区域 ID:
1. ap-northeast-1
2. ap-northeast-2
3. ap-south-1
4. ap-southeast-1
5. ap-southeast-2
6. ca-central-1
7. eu-central-1
8. eu-north-1
9. eu-west-1
10. eu-west-2
11. eu-west-3
12. sa-east-1
13. us-east-1
14. us-east-2
15. us-west-1
16. us-west-2
Amazon Web Services 区域 ID [ap-northeast-1]:

选择要用于集群的计划程序。


Allowed values for Scheduler:
1. slurm
2. awsbatch
Scheduler [awsbatch]:

当选择 awsbatch 作为计划程序时，alinux2 将用作操作系统。

输入计算节点集群的最小和最大大小。这是以 vCPUs 为单位来衡量的。


Minimum cluster size (vcpus) [0]:
Maximum cluster size (vcpus) [10]:

输入头节点实例类型。使用awsbatch调度器时，计算节点使用的实例类型为optimal。


Master instance type [t2.micro]:

Amazon EC2 key pair 是从选定的 Amazon EC2 中注册的密钥对中选择的Amazon Web Services 区域。


Allowed values for EC2 Key Pair Name:
1. prod-uswest1-key
2. test-uswest1-key
EC2 Key Pair Name [prod-uswest1-key]:

决定是使用现有 VPC 还是让我们为您Amazon ParallelCluster创建 VPC。如果没有正确配置的 VPC，Amazon ParallelCluster您可以创建新的 VPC。它要么同时使用同一个公有子网中的头节点和计算节点，要么只使用公有子网中的头节点，所有节点都在私有子网中。可以达到您对一个 VPC 数量的限制Amazon Web Services 区域。默认 VPC 数量为五个。有关此限制以及如何请求提高限制的更多信息，请参阅 Amazon VPC 用户指南中的 VPC 和子网。

重要

如果您允许Amazon ParallelCluster创建 VPC，请决定是否所有节点都应位于公有子网中。


Automate VPC creation? (y/n) [n]: y
Allowed values for Network Configuration:
1. Master in a public subnet and compute fleet in a private subnet
2. Master and compute fleet in the same public subnet
Network Configuration [Master in a public subnet and compute fleet in a private subnet]: 1
Beginning VPC creation. Please do not leave the terminal until the creation is finalized

如果您不创建新的 VPC，则必须选择现有 VPC。

如果您选择Amazon ParallelCluster创建 VPC，请记下 VPC ID，以便稍后Amazon CLI使用将其删除。


Automate VPC creation? (y/n) [n]: n
Allowed values for VPC ID:
  #  id                     name                                 number_of_subnets
---  ---------------------  ---------------------------------  -------------------
  1  vpc-0b4ad9c4678d3c7ad  ParallelClusterVPC-20200118031893                    2
  2  vpc-0e87c753286f37eef  ParallelClusterVPC-20191118233938                    5
VPC ID [vpc-0b4ad9c4678d3c7ad]: 1

选择 VPC 后，决定是使用现有子网还是创建新子网。


Automate Subnet creation? (y/n) [y]: y


Creating CloudFormation stack...
Do not leave the terminal until the process has finished

完成上述步骤后，简单集群将启动到 VPC 中。VPC 使用支持公有 IP 地址的现有子网。子网的路由表是0.0.0.0/0 => igw-xxxxxx。请注意以下几点：

VPC 必须具有 DNS Resolution = yes 和 DNS Hostnames = yes。
VPC 还应具有正确domain-name的 DHCP 选项Amazon Web Services 区域。默认 DHCP 选项集已经指定了必需的AmazonProvidedDNS。如果指定多个域名服务器，请参阅 Amazon VPC 用户指南中的 DHCP 选项集。使用私有子网时，使用 NAT 网关或内部代理为计算节点启用 Web 访问。有关更多信息，请参阅网络配置。

但所有设置都包含有效值时，您可以通过运行创建命令来启动集群：


$ pcluster create mycluster

集群达到 “CREATE_COMPLETE” 状态后，您可以使用常规 SSH 客户端设置连接到该集群。有关连接到 Amazon EC2 实例的更多信息，请参阅适用于 Linux 实例的 Amazon EC2 用户指南中的 EC2 用户指南。

要删除集群，运行以下命令。


$ pcluster delete --region us-east-1 mycluster

要删除 VPC 中的网络资源，您可以删除 CloudFormation 网络堆栈。堆栈名称以 “parallelclusternetworking-” 开头，包含 “YYYYMMDDHMSS” 格式的创建时间。您可以使用 list-stacks 命令列出堆栈。


$ aws --region us-east-1 cloudformation list-stacks \
   --stack-status-filter "CREATE_COMPLETE" \
   --query "StackSummaries[].StackName" | \
   grep -e "parallelclusternetworking-"
    "parallelclusternetworking-pubpriv-20191029205804"

可以使用 delete-stack 命令删除堆栈。


$ aws --region us-east-1 cloudformation delete-stack \
   --stack-name parallelclusternetworking-pubpriv-20191029205804

为您pcluster configure创建的 VPC 不是在 CloudFormation 网络堆栈中创建的。您可以在控制台中手动删除该 VPC，也可以使用Amazon CLI。


$ aws --region us-east-1 ec2 delete-vpc --vpc-id vpc-0b4ad9c4678d3c7ad

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