亚马逊 FSx 表现 Lustre 性能 - fsX for Lustre
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亚马逊 FSx 表现 Lustre 性能

Amazon FSx for Lustre 基于流行的高性能文件系统 Lustre 构建,可提供随文件系统大小线性增加的横向扩展性能。Lustre 文件系统可横向扩展多个文件服务器和磁盘。这种扩展允许每个客户机直接访问存储在每个磁盘上的数据,从而消除传统文件系统中存在的许多瓶颈。Amazon FSx for Lustre 建立在 Lustre 的可扩展架构之上,可为大量客户提供高水平的性能支持。

适用于 Lustre 文件系统的 FSx 是如何工作的

每个 FSx for Lustre 文件系统都由客户机与之通信的文件服务器以及连接到每个存储数据的文件服务器的一组磁盘组成。每台文件服务器都使用快速的内存缓存来增强最常访问的数据的性能。也可以为基于 HDD 的文件系统配置基于 SSD 的读取缓存,以进一步提高最常访问数据的性能。当客户端访问存储在内存缓存或 SSD 缓存中的数据时,文件服务器无需从磁盘读取数据,这样可以减少延迟并增加您可以驱动的总吞吐量。下图说明了写入操作、从磁盘提供的读取操作以及从内存或 SSD 缓存中提供的读取操作的路径。


        fsX for Lustre 性能架构。

当您读取存储在文件服务器的内存缓存或 SSD 缓存中的数据时,文件系统的性能取决于网络吞吐量。当您将数据写入文件系统或读取未存储在内存缓存中的数据时,文件系统的性能取决于网络吞吐量和磁盘吞吐量中较低的值。

当您为 HDD Lustre 文件系统配置固态硬盘缓存时,Amazon FSx 会创建一个自动调整为文件系统硬盘存储容量的 20% 的 SSD 缓存。这样做可以为经常访问的文件提供亚毫秒级的延迟和更高的 IOPS。

聚合文件系统性能

FSx for Lustre 文件系统支持的吞吐量与其存储容量成正比。适用于 Lustre 文件系统的 Amazon FSx 可扩展到数百 GBps 的吞吐量和数百万 IOPS。Amazon FSx for Lustre 还支持从数千个计算实例并行访问同一个文件或目录。这种访问可以实现从应用程序内存到存储器的快速数据检查点,这是高性能计算 (HPC) 中的常用技术。创建文件系统后,您可以随时根据需要增加存储量和吞吐容量。有关更多信息,请参阅管理存储和吞吐量容量

FSx for Lustre 文件系统使用网络 I/O 积分机制提供突发读取吞吐量,根据平均带宽利用率分配网络带宽。当文件系统的网络带宽使用量低于其基准限制时,它们会累积积额度,并且可以在执行网络数据传输时使用这些积分。

下表显示了 FSx for Lustre 部署选项所针对的性能。

硬盘存储选项的文件系统性能
部署类型 网络吞吐量(预配置 MB/s/TiB 的存储空间或 SSD 缓存) 网络 IOPS(预配置的 IOPS/TiB 存储空间) 缓存存储空间(已配置 GiB 的 RAM/TiB 存储空间) 每次文件操作的磁盘延迟(毫秒,P50) 磁盘吞吐量(预配置 Mbps/TiB 的存储空间或 SSD 缓存)

基线

爆发

基线

爆发

PERSISTENT-12
硬盘存储 40 375*

成千上万的基线

数十万人爆发

0.4 memory

元数据:亚毫秒

数据:个位数 ms

12

80(已阅读)

50(写入)

SSD 读取缓存

200

1,900

200 个固态硬盘

数据:亚毫秒

200

-

PERSISTENT-40
硬盘存储 150 1,300*

成千上万的基线

数十万人爆发

1.5

元数据:亚毫秒

数据:个位数 ms

40

250(已阅读)

150(写入)

SSD 读取缓存

750

6500

200 SSD cache

数据:亚毫秒

200

-

注意

Scratch 2 文件系统在中国区域不可用。

注意

*以下是永久性文件系统Amazon Web Services 区域提供高达每 TiB 存储空间 530 Mb/s 的网络突发:非洲(开普敦)、亚太地区(香港)、亚太地区(大阪)、亚太地区(新加坡)、加拿大(中部)、欧洲(法兰克福)、欧洲(伦敦)、欧洲(米兰)、欧洲(斯德哥尔摩)、中东(巴林)、南美(圣保罗)、中国和美国西部(洛杉矶)。

示例:聚合基准和突发吞吐量

以下示例说明了存储容量和磁盘吞吐量如何影响文件系统性能。

永久文件系统的存储容量为 4.8 TiB,每单位存储的吞吐量为 50 MB/s,其总基准磁盘吞吐量为 240 MB/s,突发磁盘吞吐量为 1.152 Gb/s。

无论文件系统大小如何,Amazon FSx for Lustre 都能为文件操作提供一致的亚毫秒级延迟。

文件系统存储布局

Lustre 中的所有文件数据都存储在名为的存储卷上对象存储目标(OST)。所有文件元数据(包括文件名、时间戳、权限等)都存储在名为的存储卷上元数据目标(MDT)。适用于 Lustre 文件系统的 Amazon FSx 由一个 MDT 和多个 OST 组成。每个 OST 的大小约为 1 到 2 TiB,具体取决于文件系统的部署类型。Amazon FSx for Lustre 将您的文件数据分散到构成文件系统的操作系统中,以平衡存储容量与吞吐量和 IOPS 负载。

要查看组成文件系统的 MDT 和 OST 的存储使用情况,请在装有文件系统的客户机上运行以下命令。

lfs df -h mount/path

此命令的输出如下所示。

UUID bytes Used Available Use% Mounted on mountname-MDT0000_UUID 68.7G 5.4M 68.7G 0% /fsx[MDT:0] mountname-OST0000_UUID 1.1T 4.5M 1.1T 0% /fsx[OST:0] mountname-OST0001_UUID 1.1T 4.5M 1.1T 0% /fsx[OST:1] filesystem_summary: 2.2T 9.0M 2.2T 0% /fsx

对文件系统中的数据进行条带化

您可以使用文件条带化来优化文件系统的吞吐量性能。Amazon FSx for Lustre 会自动将文件分散到各操作系统中,以确保所有存储服务器都能提供数据。您可以通过配置文件在多个 OST 之间进行条带化处理的方式在文件级别应用相同的概念。

条带化意味着可以将文件分成多个块,然后存储在不同的操作系统中。当文件跨多个 OST 进行条带化处理时,对该文件的读取或写入请求会分散到这些 OST 中,从而增加应用程序可以驱动的总吞吐量或 IOPS。

以下是适用于 Lustre 文件系统的亚马逊 FSx 的默认布局。

  • 对于 2020 年 12 月 18 日之前创建的文件系统,默认布局将条带数指定为 1。这意味着,除非指定不同的布局,否则使用标准 Linux 工具在 Amazon FSx for Lustre 中创建的每个文件都存储在单个磁盘上。

  • 对于 2020 年 12 月 18 日之后创建的文件系统,默认布局为渐进式文件布局,在这种布局中,大小低于 1GiB 的文件存储在一个条带中,而较大的文件则分区计数为 5。

  • 对于 2023 年 8 月 25 日之后创建的文件系统,默认布局为 4 个组件的渐进式文件布局,详情请参见渐进式文件布局

  • 对于所有文件系统,无论其创建日期如何,从 Amazon S3 导入的文件都不使用默认布局,而是使用文件系统中的布局ImportedFileChunkSize参数。S3 导入的文件大于ImportedFileChunkSize将存储在多个 OST 上,条带计数为(FileSize / ImportedFileChunksize) + 1。的默认值ImportedFileChunkSize是 1GiB。

您可以使用查看文件或目录的布局配置lfs getstripe命令。

lfs getstripe path/to/filename

此命令报告文件的条带计数、条带大小和条带偏移量。的条纹计数是该文件被条带化的操作系统数量。的条纹大小是 OST 上存储的连续数据量。的条纹偏移是该文件被条带化的第一个 OST 的索引。

修改条带化配置

文件的布局参数是在首次创建文件时设置的。使用lfs setstripe命令以指定布局创建一个新的空文件。

lfs setstripe filename --stripe-count number_of_OSTs

lfs setstripe命令仅影响新文件的布局。在创建文件之前,使用它来指定文件的布局。您也可以为目录定义布局。在目录上设置后,该布局将应用于添加到该目录的每个新文件,但不适用于现有文件。您创建的任何新子目录也会继承新的布局,然后将其应用于您在该子目录中创建的任何新文件或目录。

要修改现有文件的布局,请使用lfs migrate命令。此命令根据需要复制文件,以便根据您在命令中指定的布局分发其内容。例如,附加到或大小增加的文件不会更改条带数量,因此您必须迁移它们才能更改文件布局。或者,您可以使用创建新文件lfs setstripe命令指定其布局,将原始内容复制到新文件中,然后重命名新文件以替换原始文件。

在某些情况下,默认布局配置可能不适合您的工作负载。例如,具有数十个 OST 和大量数 GB 文件的文件系统如果将文件分成超过默认条带计数值(五个 OST),则性能可能会更高。创建条带数量较低的大文件可能会导致 I/O 性能瓶颈,还可能导致 OST 被填满。在这种情况下,您可以为这些文件创建一个条带数更大的目录。

为大型文件(尤其是大于 1 GB 的文件)设置条带布局非常重要,原因如下:

  • 允许多个 OST 及其关联服务器在读取和写入大型文件时提供 IOPS、网络带宽和 CPU 资源,从而提高吞吐量。

  • 降低一小部分 OST 成为限制整体工作负载性能的热点的可能性。

  • 防止单个大文件填满 OST,从而可能导致磁盘已满错误。

没有适用于所有用例的单一最佳布局配置。有关文件布局的详细指导,请参阅管理文件布局(条带化)和可用空间在 Lustre.org 文档中。以下是一般指导方针:

  • 条纹布局对大型文件最为重要,特别是对于文件大小通常为数百兆字节或以上的用例。因此,新文件系统的默认布局会为大小超过 1GiB 的文件分配五条带化计数。

  • 条带计数是您应针对支持大文件的系统进行调整的布局参数。条带计数指定了将容纳条带化文件块的 OST 卷的数量。例如,如果条带计数为 2,条带大小为 1MiB,Lustre 会将一个文件的 1MiB 备用区块写入两个 OST 中的每一个。

  • 有效条带数量是 OST 卷的实际数量和您指定的条带计数值中较小的一个。您可以使用特殊的条带计数值-1表示应在所有 OST 卷上放置条带。

  • 为小文件设置较大的条带数量并不理想,因为对于某些操作,Lustre 需要网络往返布局中的每个 OST,即使文件太小而无法占用所有 OST 卷上的空间。

  • 您可以设置渐进式文件布局 (PFL),允许文件布局随大小而变化。PFL 配置可以简化管理包含大文件和小文件组合的文件系统,而无需为每个文件明确设置配置。有关更多信息,请参阅渐进式文件布局

  • 默认情况下,条带大小为 1MiB。在特殊情况下,设置条带偏移量可能很有用,但一般而言,最好不指定条带偏移量并使用默认值。

渐进式文件布局

您可以为目录指定渐进式文件布局 (PFL) 配置,以便在填充目录之前为小文件和大文件指定不同的条带配置。例如,在将任何数据写入新文件系统之前,可以在顶级目录上设置 PFL。

要指定 PFL 配置,请使用lfs setstripe命令用-E用于为不同大小的文件指定布局组件的选项,例如以下命令:

lfs setstripe -E 100M -c 1 -E 10G -c 8 -E 100G -c 16 -E -1 -c 32 /mountname/directory

此命令设置了四个布局组件:

  • 第一个组件 (-E 100M -c 1) 表示对于大小不超过 100MiB 的文件,条带计数值为 1。

  • 第二个组件 (-E 10G -c 8) 表示对于大小不超过 10GiB 的文件,条带计数为 8。

  • 第三个组成部分 (-E 100G -c 16) 表示对于大小不超过 100GiB 的文件,条带计数为 16。

  • 第四个组成部分 (-E -1 -c 32) 表示对于大于 100GiB 的文件,条带计数为 32。

重要

向使用 PFL 布局创建的文件追加数据将填充其所有布局组件。例如,使用上面显示的 4 组件命令,如果您创建一个 1MiB 文件,然后在文件末尾添加数据,则该文件的布局将扩展为条带计数为 -1,即系统中的所有 OST。这并不意味着数据将被写入每个 OST,但是读取文件长度之类的操作会向每个 OST 并行发送一个请求,从而给文件系统增加大量的网络负载。

因此,请注意限制随后可能附加数据的任何中小型文件的条带数量。由于日志文件通常通过附加新记录而增长,因此 Amazon FSx for Lustre 会为在追加模式下创建的任何文件分配默认条带计数 1,无论其父目录指定的默认条带配置如何。

Amazon FSx 上在 2023 年 8 月 25 日之后创建的 Lustre 文件系统的默认 PFL 配置是使用以下命令设置的:

lfs setstripe -E 100M -c 1 -E 10G -c 8 -E 100G -c 16 -E -1 -c 32 /mountname

如果客户的工作负载对中型和大型文件具有高度并发访问权限,则客户可能会受益于这样的布局:在较小的尺寸下使用更多的条带,而对于最大的文件,则跨所有操作系统划分条带,如四部分示例布局所示。

监控性能和使用情况

每分钟,Amazon FSx for Lustre 都会向亚马逊发布每个磁盘(MDT 和 OST)的使用率指标 CloudWatch。

要查看聚合文件系统使用情况的详细信息,可以查看每个指标的总和统计信息。例如,总和DataReadBytes统计数据报告文件系统中所有 OST 看到的总读取吞吐量。同样,总和FreeDataStorageCapacity统计数据报告文件系统中文件数据的总可用存储容量。

有关监控文件系统性能的更多信息,请参阅监控 Amazon FSx for Lustre

性能小贴士

使用 Amazon FSx for Lustre 时,请记住以下性能提示。有关服务限制,请参阅配额

  • 平均 I/O 大小— 由于 Amazon FSx for Lustre 是一个网络文件系统,因此每次文件操作都要在客户端和 Amazon FSx for Lustre 之间往返,从而产生很小的延迟开销。由于这种每次操作的延迟,总吞吐量通常会随着平均 I/O 大小增加而增加,因为开销在大量数据之间分摊。

  • 请求模型— 通过启用对文件系统的异步写入,待处理的写入操作将在异步写入到 Amazon FSx for Lustre 之前在 Amazon EC2 实例上进行缓冲。异步写入通常具有较低的延迟。在执行异步写入时,内核使用额外内存进行缓存。启用同步写入功能的文件系统会向 Amazon FSx for Lustre 发出同步请求。每项操作都要在客户端和亚马逊 FSx for Lustre 之间往返。

    注意

    您选择的请求模式需要权衡一致性(如果您使用多个 Amazon EC2 实例)和速度。

  • 亚马逊 EC2 实例— 执行大量读取和写入操作的应用程序可能需要比不执行大量读取和写入操作的应用程序更多的内存或计算容量。在为计算密集型工作负载启动 Amazon EC2 实例时,请选择具有应用程序所需资源量的实例类型。适用于 Lustre 文件系统的 Amazon FSx 的性能特征不依赖于 Amazon EBS 优化实例的使用。

  • 建议针对大型客户机实例类型进行调整

    1. 要调整大型客户机实例以获得最佳性能,请执行以下操作:

      1. 对于内存超过 64 GiB 的客户端实例类型,我们建议应用以下调整:

        lctl set_param ldlm.namespaces.*.lru_max_age=600000
      2. 对于 CPU 核心超过 64 个的客户端实例类型,我们建议应用以下调整:

        echo "options ptlrpc ptlrpcd_per_cpt_max=32" >> /etc/modprobe.d/modprobe.conf echo "options ksocklnd credits=2560" >> /etc/modprobe.d/modprobe.conf # reload all kernel modules to apply the above two settings sudo reboot
    2. 装载客户机后,需要进行以下调整:

      sudo lctl set_param osc.*OST*.max_rpcs_in_flight=32 sudo lctl set_param mdc.*.max_rpcs_in_flight=64 sudo lctl set_param mdc.*.max_mod_rpcs_in_flight=50

    请注意lctl set_param已知在重启后不会持续存在。由于无法从客户端永久设置这些参数,因此建议实施启动 cron 作业,以使用推荐的调整来设置配置。

  • 各操作系统之间的工作负载平衡— 在某些情况下,您的工作负载并不能推动文件系统所能提供的聚合吞吐量(每 TiB 存储 200 MB/s)。如果是这样,你可以使用 CloudWatch 用于排除性能是否受到工作负载 I/O 模式失衡影响的指标。要确定这是否是原因,请查看最大值 CloudWatch 亚马逊 FSx 的 Lustre 指标。

    在某些情况下,此统计数据显示负载等于或高于 240 Mbps 的吞吐量(Lustre 磁盘的单个 1.2 TiB Amazon FSx 的吞吐容量)。在这种情况下,您的工作负载不会均匀地分布在磁盘上。如果是这样的话,你可以使用lfs setstripe命令修改您的工作负载最常访问的文件的条带化。为了获得最佳性能,请在构成文件系统的所有 OST 中对吞吐量要求很高的文件进行条带化。

    如果您的文件是从数据存储库导入的,则可以采用另一种方法将高吞吐量文件均匀地分散到操作系统中。为此,您可以修改ImportedFileChunkSize创建下一个适用于 Lustre 文件系统的亚马逊 FSx 时的参数。

    例如,假设您的工作负载使用 7.0-TiB 文件系统(由 6 个 1.17-TiB OST 组成),并且需要在 2.4 GiB 文件之间实现高吞吐量。在这种情况下,你可以设置ImportedFileChunkSize值为(2.4 GiB / 6 OSTs) = 400 MiB这样您的文件就可以均匀地分布在文件系统的操作系统中。