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在 Amazon ParallelCluster 上运行首个作业

本教程将引导你完成你的第一个 Hello World 任务Amazon ParallelCluster

验证安装

首先，我们验证安装和配置Amazon ParallelCluster是否正确，包括 Node.js 依赖项。

$ node --version
v16.8.0
$ pcluster version
{
  "version": "3.5.0"
}

这将返回正在运行的 Amazon ParallelCluster 版本。

创建您从中创建您从中创建

现在应该创建您的第一个集群了。由于本教程的工作负载不是性能密集型的，因此，我们可以使用 t2.micro 的默认实例大小。（对于生产工作负载，您需要选择最适合您的需求的实例大小。） 让我们给你的集群起个名字hello-world。

$ pcluster create-cluster \
    --cluster-name hello-world \
    --cluster-configuration hello-world.yaml

如果输出为您提供有关配置的消息，则需要运行以下命令进行配置Amazon ParallelCluster：

$ pcluster configure --config hello-world.yaml

如果pcluster create-cluster命令成功，则将显示类似以下内容的输出：

{
  "cluster": {
    "clusterName": "hello-world",
    "cloudformationStackStatus": "CREATE_IN_PROGRESS",
    "cloudformationStackArn": "arn:aws:cloudformation:xxx:stack/xxx",
    "region": "...",
    "version": "...",
    "clusterStatus": "CREATE_IN_PROGRESS"
  }
}

您可以使用以下方法监控集群的创建：

$ pcluster describe-cluster --cluster-name hello-world

在创建集群时clusterStatus报告CREATE_IN_PROGRESS “”。成功创建群集后，会clusterStatus转换为CREATE_COMPLETE “”。输出还为我们提供了头节点privateIpAddress的publicIpAddress和。

登录您的头节点

使用您的 OpenSSH pem 文件登录您的头节点。

$ pcluster ssh --cluster-name hello-world -i /path/to/keyfile.pem

登录后，请运行命令 sinfo 以验证您的计算节点是否已设置和配置。

$ sinfo
PARTITION AVAIL  TIMELIMIT  NODES  STATE NODELIST
queue1*      up   infinite     10  idle~ queue1-dy-queue1t2micro-[1-10]

输出显示我们的集群中有一个队列，最多有十个节点。

使用 Slurm 运行你的第一份作业

接下来，我们将创建一个作业，该作业睡眠一小段时间，然后输出它自己的主机名。使用以下内容创建名为 hellojob.sh 的文件。

#!/bin/bash
sleep 30
echo "Hello World from $(hostname)"

接下来，使用 sbatch 提交作业，并验证其是否运行。

$ sbatch hellojob.sh
Submitted batch job 2

现在，您可以查看您的队列并检查该作业的状态。新的 Amazon EC2 实例的配置在后台开始。您可以使用该sinfo命令监控集群实例的状态。

$ squeue
             JOBID PARTITION     NAME     USER ST       TIME  NODES NODELIST(REASON)
                 2    queue1 hellojob ec2-user CF       3:30      1 queue1-dy-queue1t2micro-1

输出显示任务已提交给queue1。请等候 30 秒，以便作业完成，然后再次运行 squeue。

$ squeue
             JOBID PARTITION     NAME     USER ST       TIME  NODES NODELIST(REASON)

现在，队列中没有作业，我们可以检查当前目录中的输出。

$ ls -l
total 8
-rw-rw-r-- 1 ec2-user ec2-user 57 Sep  1 14:25 hellojob.sh
-rw-rw-r-- 1 ec2-user ec2-user 43 Sep  1 14:30 slurm-2.out

在输出中，我们看到一个 “out” 文件。我们可以看到我们工作的输出：

$ cat slurm-2.out
Hello World from queue1-dy-queue1t2micro-1

输出还显示我们的作业已在实例 queue1-dy-queue1t2micro-1 上成功运行。

在您刚刚创建的集群中，只有主目录在群集的所有节点之间共享。

要了解有关创建和使用集群的更多信息，请参阅最佳实践。