Amazon Boto3 - Amazon SageMaker
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Amazon Boto3

可以使用 B Amazon oto SageMaker 3 客户端的create_training_job()功能为训练作业配置 Amazon D SageMaker ebugger 内置规则。您需要在 RuleEvaluatorImage 参数中指定正确的映像 URI,以下示例演示如何为 create_training_job() 函数设置请求正文。

以下代码显示了一个完整的示例,说明如何为create_training_job()请求正文配置 Debugger 并在中us-west-2启动训练作业(假设使用 TensorFlow准备了训练脚本entry_point/train.py)。要查找 end-to-end 示例笔记本,请参阅使用 Amazon D SageMaker ebugger 分析多 GPU TensorFlow 多节点训练 Job (Boto3)

注意

确保使用正确的 Docker 容器映像。要查找可用的 Amazon 深度学习容器镜像,请参阅可用的 Deep Learning Containers 镜像。要查找使用 Debugger 规则时可用的 Docker 映像的完整列表,请参阅将 Debugger Docker 映像用于内置规则或自定义规则

import sagemaker, boto3 import datetime, tarfile # Start setting up a SageMaker session and a Boto3 SageMaker client session = sagemaker.Session() region = session.boto_region_name bucket = session.default_bucket() # Upload a training script to a default Amazon S3 bucket of the current SageMaker session source = 'source.tar.gz' project = 'debugger-boto3-test' tar = tarfile.open(source, 'w:gz') tar.add ('entry_point/train.py') # Specify the directory and name of your training script tar.close() s3 = boto3.client('s3') s3.upload_file(source, bucket, project+'/'+source) # Set up a Boto3 session client for SageMaker sm = boto3.Session(region_name=region).client("sagemaker") # Start a training job sm.create_training_job( TrainingJobName='debugger-boto3-'+datetime.datetime.now().strftime('%Y-%m-%d-%H-%M-%S'), HyperParameters={ 'sagemaker_submit_directory': 's3://'+bucket+'/'+project+'/'+source, 'sagemaker_program': '/entry_point/train.py' # training scrip file location and name under the sagemaker_submit_directory }, AlgorithmSpecification={ # Specify a training Docker container image URI (Deep Learning Container or your own training container) to TrainingImage. 'TrainingImage': '763104351884.dkr.ecr.us-west-2.amazonaws.com/tensorflow-training:2.4.1-gpu-py37-cu110-ubuntu18.04', 'TrainingInputMode': 'File', 'EnableSageMakerMetricsTimeSeries': False }, RoleArn='arn:aws:iam::111122223333:role/service-role/AmazonSageMaker-ExecutionRole-20201014T161125', OutputDataConfig={'S3OutputPath': 's3://'+bucket+'/'+project+'/output'}, ResourceConfig={ 'InstanceType': 'ml.p3.8xlarge', 'InstanceCount': 1, 'VolumeSizeInGB': 30 }, StoppingCondition={ 'MaxRuntimeInSeconds': 86400 }, DebugHookConfig={ 'S3OutputPath': 's3://'+bucket+'/'+project+'/debug-output', 'CollectionConfigurations': [ { 'CollectionName': 'losses', 'CollectionParameters' : { 'train.save_interval': '500', 'eval.save_interval': '50' } } ] }, DebugRuleConfigurations=[ { 'RuleConfigurationName': 'LossNotDecreasing', 'RuleEvaluatorImage': '895741380848.dkr.ecr.us-west-2.amazonaws.com/sagemaker-debugger-rules:latest', 'RuleParameters': {'rule_to_invoke': 'LossNotDecreasing'} } ], ProfilerConfig={ 'S3OutputPath': 's3://'+bucket+'/'+project+'/profiler-output', 'ProfilingIntervalInMilliseconds': 500, 'ProfilingParameters': { 'DataloaderProfilingConfig': '{"StartStep": 5, "NumSteps": 3, "MetricsRegex": ".*", }', 'DetailedProfilingConfig': '{"StartStep": 5, "NumSteps": 3, }', 'PythonProfilingConfig': '{"StartStep": 5, "NumSteps": 3, "ProfilerName": "cprofile", "cProfileTimer": "total_time"}', 'LocalPath': '/opt/ml/output/profiler/' # Optional. Local path for profiling outputs } }, ProfilerRuleConfigurations=[ { 'RuleConfigurationName': 'ProfilerReport', 'RuleEvaluatorImage': '895741380848.dkr.ecr.us-west-2.amazonaws.com/sagemaker-debugger-rules:latest', 'RuleParameters': {'rule_to_invoke': 'ProfilerReport'} } ] )

配置 Debugger 规则以调试模型参数

以下代码示例展示了如何使用此 SageMaker API 配置内置VanishingGradient规则。

启用 Debugger 收集输出张量

按如下方式指定 Debugger 钩子配置:

DebugHookConfig={ 'S3OutputPath': 's3://<default-bucket>/<training-job-name>/debug-output', 'CollectionConfigurations': [ { 'CollectionName': 'gradients', 'CollectionParameters' : { 'train.save_interval': '500', 'eval.save_interval': '50' } } ] }

这将使训练作业按每 500 个步骤的 save_interval 保存一次 gradients 张量集合。要查找可用 CollectionName 值,请参阅 SMDebug 客户端库文档中的 Debugger 内置集合。要查找可用的CollectionParameters参数键和值,请参阅 SageMaker Python SDK 文档中的sagemaker.debugger.CollectionConfig类。

启用 Debugger 规则来调试输出张量

以下DebugRuleConfigurations API 示例说明了如何对已保存的 gradients 集合运行内置 VanishingGradient 规则。

DebugRuleConfigurations=[ { 'RuleConfigurationName': 'VanishingGradient', 'RuleEvaluatorImage': '895741380848.dkr.ecr.us-west-2.amazonaws.com/sagemaker-debugger-rules:latest', 'RuleParameters': { 'rule_to_invoke': 'VanishingGradient', 'threshold': '20.0' } } ]

通过类似于此示例中的配置,Debugger 使用 VanishingGradient 规则,在 gradients 张量的集合上为您的训练作业启动规则评估作业。要查找使用 Debugger 规则时可用的 Docker 映像的完整列表,请参阅将 Debugger Docker 映像用于内置规则或自定义规则。要查找 RuleParameters 的键值对,请参阅 Debugger 内置规则列表

为分析系统和框架指标配置 Debugger 内置规则

以下示例代码演示如何指定 ProfilerConfig API 操作以启用收集系统和框架指标。

启用 Debugger 分析以收集系统和框架指标

Target Step
ProfilerConfig={ 'S3OutputPath': 's3://<default-bucket>/<training-job-name>/profiler-output', # Optional. Path to an S3 bucket to save profiling outputs # Available values for ProfilingIntervalInMilliseconds: 100, 200, 500, 1000 (1 second), 5000 (5 seconds), and 60000 (1 minute) milliseconds. 'ProfilingIntervalInMilliseconds': 500, 'ProfilingParameters': { 'DataloaderProfilingConfig': '{ "StartStep": 5, "NumSteps": 3, "MetricsRegex": ".*" }', 'DetailedProfilingConfig': '{ "StartStep": 5, "NumSteps": 3 }', 'PythonProfilingConfig': '{ "StartStep": 5, "NumSteps": 3, "ProfilerName": "cprofile", # Available options: cprofile, pyinstrument "cProfileTimer": "total_time" # Include only when using cprofile. Available options: cpu, off_cpu, total_time }', 'LocalPath': '/opt/ml/output/profiler/' # Optional. Local path for profiling outputs } }
Target Time Duration
ProfilerConfig={ 'S3OutputPath': 's3://<default-bucket>/<training-job-name>/profiler-output', # Optional. Path to an S3 bucket to save profiling outputs # Available values for ProfilingIntervalInMilliseconds: 100, 200, 500, 1000 (1 second), 5000 (5 seconds), and 60000 (1 minute) milliseconds. 'ProfilingIntervalInMilliseconds': 500, 'ProfilingParameters': { 'DataloaderProfilingConfig': '{ "StartTimeInSecSinceEpoch": 12345567789, "DurationInSeconds": 10, "MetricsRegex": ".*" }', 'DetailedProfilingConfig': '{ "StartTimeInSecSinceEpoch": 12345567789, "DurationInSeconds": 10 }', 'PythonProfilingConfig': '{ "StartTimeInSecSinceEpoch": 12345567789, "DurationInSeconds": 10, "ProfilerName": "cprofile", # Available options: cprofile, pyinstrument "cProfileTimer": "total_time" # Include only when using cprofile. Available options: cpu, off_cpu, total_time }', 'LocalPath': '/opt/ml/output/profiler/' # Optional. Local path for profiling outputs } }

启用 Debugger 规则来分析指标

以下示例代码显示了如何配置 ProfilerReport 规则。

ProfilerRuleConfigurations=[ { 'RuleConfigurationName': 'ProfilerReport', 'RuleEvaluatorImage': '895741380848.dkr.ecr.us-west-2.amazonaws.com/sagemaker-debugger-rules:latest', 'RuleParameters': { 'rule_to_invoke': 'ProfilerReport', 'CPUBottleneck_cpu_threshold': '90', 'IOBottleneck_threshold': '90' } } ]

要查找使用 Debugger 规则时可用的 Docker 映像的完整列表,请参阅将 Debugger Docker 映像用于内置规则或自定义规则。要查找 RuleParameters 的键值对,请参阅 Debugger 内置规则列表

使用 UpdateTrainingJob API 操作更新 Debugger 分析配置

在训练作业运行期间,可以使用 Amazon Boto SageMaker 3 客户端的update_training_job()功能更新调试器分析配置。配置新的ProfilerConfigProfilerRuleConfiguration对象,并在TrainingJobName参数中指定训练作业名称。

ProfilerConfig={ 'DisableProfiler': boolean, 'ProfilingIntervalInMilliseconds': number, 'ProfilingParameters': { 'string' : 'string' } }, ProfilerRuleConfigurations=[ { 'RuleConfigurationName': 'string', 'RuleEvaluatorImage': 'string', 'RuleParameters': { 'string' : 'string' } } ], TrainingJobName='your-training-job-name-YYYY-MM-DD-HH-MM-SS-SSS'

在 CreateTrainingJob API 操作中添加调试器自定义规则配置

可以使用 Amazon Boto3 SageMaker 客户端的函数使用 DebugHookConfig DebugRuleConfiguration对象为训练作业配置自定义规则。create_training_job()以下代码示例显示了如何使用此 SageMaker API 操作配置使用 smdebug 库编写的自定义ImproperActivation规则。此示例假定您已在 custom_rules.py 文件中编写自定义规则,并将其上传到 Amazon S3 存储桶。该示例提供了预构建的 Docker 映像,您可以使用这些映像运行自定义规则。自定义规则评估器的 Amazon SageMaker Debugger 注册表 URL 中列出了这些映像。您可以在 RuleEvaluatorImage 参数中为预构建的 Docker 映像指定 URL 注册表地址。

DebugHookConfig={ 'S3OutputPath': 's3://<default-bucket>/<training-job-name>/debug-output', 'CollectionConfigurations': [ { 'CollectionName': 'relu_activations', 'CollectionParameters': { 'include_regex': 'relu', 'save_interval': '500', 'end_step': '5000' } } ] }, DebugRulesConfigurations=[ { 'RuleConfigurationName': 'improper_activation_job', 'RuleEvaluatorImage': '552407032007.dkr.ecr.ap-south-1.amazonaws.com/sagemaker-debugger-rule-evaluator:latest', 'InstanceType': 'ml.c4.xlarge', 'VolumeSizeInGB': 400, 'RuleParameters': { 'source_s3_uri': 's3://bucket/custom_rules.py', 'rule_to_invoke': 'ImproperActivation', 'collection_names': 'relu_activations' } } ]

要查找使用 Debugger 规则时可用的 Docker 映像的完整列表,请参阅将 Debugger Docker 映像用于内置规则或自定义规则。要查找 RuleParameters 的键值对,请参阅 Debugger 内置规则列表