使用 Amazon SageMaker Feature Store Spark 批量摄取 - Amazon SageMaker
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使用 Amazon SageMaker Feature Store Spark 批量摄取

Amazon SageMaker Feature Store Spark 是一个 Spark 连接器,可将 Spark 库连接到 Feature Store。Feature Store Spark 简化了从 Spark DataFrame 到特征组的数据摄取流程。Feature Store 支持使用现有 ETL 管道在 Amazon EMR、GIS、Amazon Glue 作业、Amazon SageMaker Processing 作业或 SageMaker 笔记本上使用 Spark 进行批量数据摄取。

我们为 Python 和 Scala 开发人员提供了安装和实施批量数据摄取的方法。Python 开发人员可以按照 Amazon SageMaker Feature Store Spark GitHub 存储库中的说明,使用开源 sagemaker-feature-store-pyspark Python 库进行本地开发、在 Amazon EMR 上安装以及用于 Jupyter 笔记本。Scala 开发人员可以使用 Amazon SageMaker Feature Store Spark SDK Maven Central 存储库中提供的 Feature Store Spark 连接器。

可以通过以下方式使用 Spark 连接器摄取数据,具体取决于是启用了在线存储、离线存储,还是两者均已启用。

  1. 默认摄取 - 如果启用了在线存储,Spark 连接器将首先使用 PutRecord API 将您的数据框摄取到在线存储中。在线存储仅保留事件时间最长的记录。如果启用了离线存储,Feature Store 将在 15 分钟内将您的数据框提取到离线存储中。有关在线和离线存储工作原理的更多信息,请参阅 Feature Store 概念

    您可以通过不在 .ingest_data(...) 方法中指定 target_stores 来完成此操作。

  2. 离线存储直接摄取 - 如果启用了离线存储,Spark 连接器会将您的数据框直接批量摄取到离线存储中。将数据框直接摄取到离线存储并不会更新在线存储。

    您可以通过在 .ingest_data(...) 方法中设置 target_stores=["OfflineStore"] 来完成此操作。

  3. 仅在线存储 - 如果启用了在线存储,Spark 连接器会使用 PutRecord API 将您的数据框摄取到在线存储中。将数据框直接摄取到在线存储并不会更新离线存储。

    您可以通过在 .ingest_data(...) 方法中设置 target_stores=["OnlineStore"] 来完成此操作。

有关使用不同摄取方法的信息,请参阅示例实施

Feature Store Spark 安装

Scala 用户

Scala 用户可在 Amazon SageMaker Feature Store Spark SDK Maven Central 存储库中找到 Feature Store Spark SDK。

要求

  • Spark >= 3.0.0 且 <= 3.3.0

  • iceberg-spark-runtime >= 0.14.0

  • Scala >= 2.12.x 

  • Amazon EMR >= 6.1.0(仅当使用 Amazon EMR 时)

在 POM.xml 中声明依赖项

Feature Store Spark 连接器在 iceberg-spark-runtime 库中有一个依赖项。因此,如果要将数据摄取到使用 Iceberg 表格式自动创建的特征组中,则必须将相应版本的 iceberg-spark-runtime 库添加到该依赖项中。例如,如果使用的是 Spark 3.1,则必须在项目的 POM.xml 中声明以下内容:

<dependency> <groupId>software.amazon.sagemaker.featurestore</groupId> <artifactId>sagemaker-feature-store-spark-sdk_2.12</artifactId> <version>1.0.0</version> </dependency> <dependency> <groupId>org.apache.iceberg</groupId> <artifactId>iceberg-spark-runtime-3.1_2.12</artifactId> <version>0.14.0</version> </dependency>

Python 用户

开源 Amazon SageMaker Feature Store Spark GitHub 存储库中提供 Feature Store Spark SDK。

要求

  • Spark >= 3.0.0 且 <= 3.3.0

  • Amazon EMR >= 6.1.0(仅当使用 Amazon EMR 时)

  • 内核 = conda_python3

我们建议将 $SPARK_HOME 设置为安装了 Spark 的目录。安装期间,Feature Store 会将所需的 JAR 上传到 SPARK_HOME,这样就会自动加载依赖项。需要使用 Spark 启动 JVM,才能使这个 PySpark 库正常运行。

本地安装

要查找有关安装的更多信息,请通过将 --verbose 附加到以下安装命令来启用详细模式。

pip3 install sagemaker-feature-store-pyspark-3.1 --no-binary :all:

在 Amazon EMR 上安装

使用发行版 6.1.0 或更高版本创建一个 Amazon EMR 集群。启用 SSH 可帮助您解决任何问题。

可以执行以下操作之一来安装库:

  • 在 Amazon EMR 中创建自定义步骤。

  • 使用 SSH 连接到您的集群并从那里安装库。

注意

以下信息使用 Spark 版本 3.1,但您可以指定满足要求的任何版本。

export SPARK_HOME=/usr/lib/spark sudo -E pip3 install sagemaker-feature-store-pyspark-3.1 --no-binary :all: --verbose
注意

如果要将从属 JAR 自动安装到 SPARK_HOME,请勿使用引导步骤。

在 SageMaker 笔记本实例上安装

使用以下命令安装与 Spark 连接器兼容的 PySpark 版本:

!pip3 install pyspark==3.1.1 !pip3 install sagemaker-feature-store-pyspark-3.1 --no-binary :all:

如果您要对离线存储执行批量摄取,则依赖项不在笔记本实例环境中。

from pyspark.sql import SparkSession import feature_store_pyspark extra_jars = ",".join(feature_store_pyspark.classpath_jars()) spark = SparkSession.builder \ .config("spark.jars", extra_jars) \ .config("spark.jars.packages", "org.apache.hadoop:hadoop-aws:3.2.1,org.apache.hadoop:hadoop-common:3.2.1") \ .getOrCreate()

在带有 GIS 的笔记本上安装

重要

必须使用 Amazon Glue 版本 2.0 或更高版本。

可以使用以下信息来帮助在 Amazon Glue 交互式会话 (GIS) 中安装 PySpark 连接器。

Amazon SageMaker Feature Store Spark 需要在会话初始化期间将特定 Spark 连接器 JAR 上传到您的 Amazon S3 存储桶。有关将所需 JAR 上传到 S3 存储桶的更多信息,请参阅检索 Feature Store Spark 的 JAR

上传 JAR 后,必须使用以下命令为 GIS 会话提供 JAR。

%extra_jars s3:/<YOUR_BUCKET>/spark-connector-jars/sagemaker-feature-store-spark-sdk.jar

要在 Amazon Glue 运行时系统中安装 Feature Store Spark,请使用 GIS 笔记本中的 %additional_python_modules 魔术命令。Amazon Glue 运行 pip 到您在 %additional_python_modules 下指定的模块。

%additional_python_modules sagemaker-feature-store-pyspark-3.1

启动 Amazon Glue 会话之前,必须使用前面的两个魔术命令。

在 Amazon Glue 作业中安装

重要

必须使用 Amazon Glue 版本 2.0 或更高版本。

要在 Amazon Glue 作业中安装 Spark 连接器,请在创建 Amazon Glue 作业时使用 --extra-jars 参数提供必要的 JAR,并使用 --additional-python-modules 将 Spark 连接器作为作业参数安装,如以下示例所示。有关将所需 JAR 上传到 S3 存储桶的更多信息,请参阅检索 Feature Store Spark 的 JAR

glue_client = boto3.client('glue', region_name=region) response = glue_client.create_job( Name=pipeline_id, Description='Feature Store Compute Job', Role=glue_role_arn, ExecutionProperty={'MaxConcurrentRuns': max_concurrent_run}, Command={ 'Name': 'glueetl', 'ScriptLocation': script_location_uri, 'PythonVersion': '3' }, DefaultArguments={ '--TempDir': temp_dir_location_uri, '--additional-python-modules': 'sagemaker-feature-store-pyspark-3.1', '--extra-jars': "s3:/<YOUR_BUCKET>/spark-connector-jars/sagemaker-feature-store-spark-sdk.jar", ... }, MaxRetries=3, NumberOfWorkers=149, Timeout=2880, GlueVersion='3.0', WorkerType='G.2X' )

在 Amazon SageMaker Processing 作业中安装

要在 Amazon SageMaker Processing 作业中使用 Feature Store Spark,请自带映像。有关自带映像的更多信息,请参阅自带 SageMaker 映像。向 Dockerfile 添加安装步骤。将 Docker 映像推送到 Amazon ECR 存储库后,您可以使用 PySpark 处理器创建处理作业。有关使用 PySpark 处理器创建处理作业的更多信息,请参阅使用 Apache Spark 进行数据处理

以下是向 Dockerfile 添加安装步骤的示例。

FROM <ACCOUNT_ID>.dkr.ecr.<AWS_REGION>.amazonaws.com/sagemaker-spark-processing:3.1-cpu-py38-v1.0 RUN /usr/bin/python3 -m pip install sagemaker-feature-store-pyspark-3.1 --no-binary :all: --verbose

检索 Feature Store Spark 的 JAR

要检索 Feature Store Spark 依赖项 JAR,必须在任何具有网络访问权限的 Python 环境中使用 pip 从 Python Package Index (PyPI) 存储库中安装 Spark 连接器。SageMaker Jupyter Notebook 就是一个具有网络访问权限的 Python 环境的示例。

以下命令用于安装 Spark 连接器。

!pip install sagemaker-feature-store-pyspark-3.1

安装 Feature Store Spark 后,您可以检索 JAR 位置并将 JAR 上传到 Amazon S3。

feature-store-pyspark-dependency-jars 命令提供了 Feature Store Spark 添加的必要依赖项 JAR 的位置。您可以使用该命令来检索 JAR,并将其上传到 Amazon S3。

jar_location = !feature-store-pyspark-dependency-jars jar_location = jar_location[0] s3_client = boto3.client("s3") s3_client.upload_file(jar_location, "<YOUR_BUCKET>","spark-connector-jars/sagemaker-feature-store-spark-sdk.jar")

示例实施

Example Python script

FeatureStoreBatchIngestion.py

from pyspark.sql import SparkSession from feature_store_pyspark.FeatureStoreManager import FeatureStoreManager import feature_store_pyspark spark = SparkSession.builder \ .getOrCreate() # Construct test DataFrame columns = ["RecordIdentifier", "EventTime"] data = [("1","2021-03-02T12:20:12Z"), ("2", "2021-03-02T12:20:13Z"), ("3", "2021-03-02T12:20:14Z")] df = spark.createDataFrame(data).toDF(*columns) # Initialize FeatureStoreManager with a role arn if your feature group is created by another account feature_store_manager= FeatureStoreManager("arn:aws:iam::111122223333:role/role-arn") # Load the feature definitions from input schema. The feature definitions can be used to create a feature group feature_definitions = feature_store_manager.load_feature_definitions_from_schema(df) feature_group_arn = "arn:aws:sagemaker:<AWS_REGION>:<ACCOUNT_ID>:feature-group/<YOUR_FEATURE_GROUP_NAME>" # Ingest by default. The connector will leverage PutRecord API to ingest your data in stream # https://docs.aws.amazon.com/sagemaker/latest/APIReference/API_feature_store_PutRecord.html feature_store_manager.ingest_data(input_data_frame=df, feature_group_arn=feature_group_arn) # To select the target stores for ingestion, you can specify the target store as the paramter # If OnlineStore is selected, the connector will leverage PutRecord API to ingest your data in stream feature_store_manager.ingest_data(input_data_frame=df, feature_group_arn=feature_group_arn, target_stores=["OfflineStore", "OnlineStore"]) # If only OfflineStore is selected, the connector will batch write the data to offline store directly feature_store_manager.ingest_data(input_data_frame=df, feature_group_arn=feature_group_arn, target_stores=["OfflineStore"]) # To retrieve the records failed to be ingested by spark connector failed_records_df = feature_store_manager.get_failed_stream_ingestion_data_frame()

使用示例 Python 脚本提交 Spark 作业

PySpark 版本需要导入额外的从属 JAR,因此运行 Spark 应用程序需要额外的步骤。

如果您在安装期间未指定 SPARK_HOME,则在运行 spark-submit 时必须在 JVM 中加载所需的 JAR。feature-store-pyspark-dependency-jars 是 Spark 库安装的 Python 脚本,用于自动为您获取所有 JAR 的路径。

spark-submit --jars `feature-store-pyspark-dependency-jars` FeatureStoreBatchIngestion.py

如果要在 Amazon EMR 上运行此应用程序,我们建议您在客户端模式下运行该应用程序,这样就无需将从属 JAR 分配给其他任务节点。使用类似于以下内容的 Spark 参数在 Amazon EMR 集群中再添加一个步骤:

spark-submit --deploy-mode client --master yarn s3:/<PATH_TO_SCRIPT>/FeatureStoreBatchIngestion.py
Example Scala script

FeatureStoreBatchIngestion.scala

import software.amazon.sagemaker.featurestore.sparksdk.FeatureStoreManager import org.apache.spark.sql.types.{StringType, StructField, StructType} import org.apache.spark.sql.{Row, SparkSession} object TestSparkApp { def main(args: Array[String]): Unit = { val spark = SparkSession.builder().getOrCreate() // Construct test DataFrame val data = List( Row("1", "2021-07-01T12:20:12Z"), Row("2", "2021-07-02T12:20:13Z"), Row("3", "2021-07-03T12:20:14Z") ) val schema = StructType( List(StructField("RecordIdentifier", StringType), StructField("EventTime", StringType)) ) val df = spark.createDataFrame(spark.sparkContext.parallelize(data), schema) // Initialize FeatureStoreManager with a role arn if your feature group is created by another account val featureStoreManager = new FeatureStoreManager("arn:aws:iam::111122223333:role/role-arn") // Load the feature definitions from input schema. The feature definitions can be used to create a feature group val featureDefinitions = featureStoreManager.loadFeatureDefinitionsFromSchema(df) val featureGroupArn = "arn:aws:sagemaker:<AWS_REGION>:<ACCOUNT_ID>:feature-group/<YOUR_FEATURE_GROUP_NAME>" // Ingest by default. The connector will leverage PutRecord API to ingest your data in stream // https://docs.aws.amazon.com/sagemaker/latest/APIReference/API_feature_store_PutRecord.html featureStoreManager.ingestData(df, featureGroupArn) // To select the target stores for ingestion, you can specify the target store as the paramter // If OnlineStore is selected, the connector will leverage PutRecord API to ingest your data in stream featureStoreManager.ingestData(df, featureGroupArn, List("OfflineStore", "OnlineStore")) // If only OfflineStore is selected, the connector will batch write the data to offline store directly featureStoreManager.ingestData(df, featureGroupArn, ["OfflineStore"]) // To retrieve the records failed to be ingested by spark connector val failedRecordsDf = featureStoreManager.getFailedStreamIngestionDataFrame() } }

提交 Spark 作业

Scala

您应该能够将 Feature Store Spark 作为一个正常的依赖项来使用。无需额外的指令即可在所有平台上运行该应用程序。